全外显子组数据结合精准规范的生物信息学分析和医学遗传学分析，能够与遗传病患者群体复杂多变、高度异质的临床表现进行关联对应，从而有效地辅助、解决大部分遗传病的分子诊断难题。近年来，随着人类对于自身基因组序列构成的认识逐渐拓宽与加深。在基因领域仍有源源不断的与遗传病相关的新基因被发现和报道。同时，内含子序列上的致病变异也不断被发现鉴定。
为了及时跟进甚至引领行业在全外显子组测序检测方面前进的步伐与方向，并用更全面的数据结合、更清晰的报告内容和更可信的分析结果服务临床医患，金域医学在多轮严格临床验证的基础上对现有全外显子组测序系列项目进行全面升级。
探针覆盖范围显著延伸：
囊括更多内含子致病变异
解决痛点1：非外显子区域上重要变异的检测。随着对基因结构与功能认知，逐渐发现并报道内含子深处的部分变异对疾病发生有重要意义，目前大部分商用的全外显子组探针覆盖范围主要是基因外显子区域，对于非外显子区的重要变异，往往需要单独进行Sanger测序或其他方法补充检测。
金域医学基于最新数据库报告及过往数十年的工作经验积累，通过自主设计升级探针，将全外的检测范围扩大覆盖已知内含子致病变异所在区域（如HBB、DMD和PTS内含子深处变异、GJB2基因5’UTR区等）[1-3]，实现了对外显子区及有临床重要意义的启动子区/UTR区/内含子区/基因间区变异的全面检测，进一步提高临床诊断效率。
解决痛点2：CNV分析的精准检测。过去CNV分析的分析方法相对单一，检测探针不够密，从而影响CNV分析的分辨率和准确率，而且许多全外检测家庭需要同时进行CNV分析，以往通常采用CMA进行检测拷贝数变异分析，费用较高。因此，在整套探针中除覆盖外显子及内含子已知致病变异探针外，自主设计增补额外探针，提高测序数据对基因组整体序列覆盖的均一性，并对序列复杂的特殊区域进行专项探针开发设计，有效提高CNV分析的准确性和敏感性。对大于100kb的拷贝数变异检测敏感度为99%，对小于100kb的拷贝数变异检出率取决于基因组结构和相关区域的测序质量，根据对已有数据的回顾，最小检出的片段可达到几kb大小。
高密度探针均一性覆盖基因组序列
多种变异一站式分析：
兼顾SNV及各类型CNV
分析过程启用了表型驱动式分析模式，进行临床表型精准匹配，筛选重点关注基因，将分析聚焦到与受检者临床高度相关的基因上，更准确快速的辅助变异解读。数据库更新完全基于国内外正版授权的数据库的更新进度以及定期更新的内部数据库，以最前沿的知识，专业地服务于临床诊断。
整合SNV 和CNV变异注释分析。本次升级后的全外检测不仅扩展了针对单核苷酸变异及小片段插入变异的技术可检测范围，统一和规范了SNV的解读规则，同时通过集团生信团队的技术攻关，自主研发了CNV可视化分析工具。更新后的全外项目不仅实现染色体三倍体和非整倍体、外显子水平CNV (非首末) 的检测，同时增加了LOH的检测，再一次扩大了临床全外的应用范围，可进一步辅助临床进行鉴别诊断。
结合ACMG和ClinGen的指南，由多位在ABMGG认证专家和有丰富经验的分子遗传顶尖专家亲自指导，对医学分析人员进行了严格的培训和考核，对整体分析流程进行高度的规范化，并将持续进行迭代。
基于高质量WES数据的CNV分析——LOH示例
基于高质量WES数据的CNV分析——拷贝数重复示例
贴近临床实际需求
结合临床反馈、专家团队意见及临床单基因遗传病基因检测报告行业规范，对全外报告模板也进行了全面升级改版。报告形式上一改原模板中单表报告的形式，按照各变异结果对临床诊疗的意义分表展示并配以针对性的疾病、变异解释和临床建议，报告阅读难度下降，而且清晰度和逻辑性明显改善。同时，所有全外报告将统一附带临床诊疗的必要Sanger测序结果，内容更加完整。
后期还将持续对报告模板进行升级迭代，包括对检测信息和变异进行更完整的报告，以便为临床提供更好更专业的服务！
作为第三方医检的龙头企业，金域医学基因组中心专注于人类基因组检测领域，已形成了集细胞遗传、分子细胞遗传、分子遗传、分子病理和生物信息为一体的综合性临床服务中心。中心建立了完善的质量管理体系，先后通过了CAP及ISO15189认可、ISO9001质量体系认证。中心开展了数百种检测项目，主要集中在遗传性疾病与肿瘤分子检测方向，并逐步开展了生殖遗传方向的检测。
金域医学基因组平台
针对全外显子组测序项目，金域医学拥有稳定准确的测序数据、紧跟前沿的数据库体系、同步国际最新标准的分析体系、不断迭代进化的报告内容与形式等优势，并拥有顶尖专家率领的具有国际化水平的分析团队，在金域医学多技术平台的支持下，可以为遗传病诊断提供完整的解决方案。
参考文献
[1]MA, Fiori L, Meli C, et al. Phenotypic Variability, Neurological Outcome and Genetics Background of 6-Pyruvoyl-Tetrahydropterin Synthase Deficiency. Clinical Genetics,2010.77(3):249-257.
[2]Khatami S, Dehnabeh SR, Zeinali S, Thöny B, Alaei M, Salehpour S, Setoodeh A, Rohani F, Hajivalizadeh F, Samavat A. Four Years of Diagnostic Challenges with Tetrahydrobiopterin Deficiencies in Iranian Patients.JIMD Rep,2017.32:7-14.
[3]Lewis BA, Kim TK, Orkin SH. A Downstream Element in the Human Beta-Globin Promoter: Evidence of Extended Sequence-Specific Transcription Factor Iid Contacts. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2000.97(13):7172-7177.
